More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_R0066 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_R0064  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0324982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0066  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.572746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0044  tRNA-Phe  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000279545  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0568  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 155 bp  77.8  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0039  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0073  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0051  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00174909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0016  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0045  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.38558  normal  0.327306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.837843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2270  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.105735  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0442  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1357  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.503492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2143  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1750  tRNA-Phe  87.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0289  tRNA-Phe  88.71 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0054  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  86.49 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t03  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t60  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0091  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA76  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R9  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0027  tRNA-Phe  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.293846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000227587  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0034  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0005  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0053  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000574289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0046  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>