299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0073 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0039  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0073  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.856426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.856426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0022  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.052558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0566  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0036  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0089  tRNA-Phe  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1216  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.777454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0035  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0179  tRNA-Phe  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R13  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0034  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000084098  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt017  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00428757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0046  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0034  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0046  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0064  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0324982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0066  tRNA-Phe  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.572746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0045  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.38558  normal  0.327306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>