More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4150 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4139  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.32664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4150  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0021  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000531965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t079  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t081  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t091  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t100  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000153181  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0091  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0087  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0020  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000569791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0105  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000135806  normal  0.713625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0102  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0047  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0045  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0032  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0111  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000403582  normal  0.792835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0165  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.337836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0020  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.963611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0109  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000406559  normal  0.781689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0030  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000136397  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0085  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0384171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0025  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0139  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457093  normal  0.0810294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0133  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.091812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0102  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000613191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0108  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000869293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0043  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000783978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0039  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000106148  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0100  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000189649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0023  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00944199  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0051  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0053  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0124  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101919  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0052  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0054  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.743391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0124  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000733103  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0026  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0580747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0112  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0390211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0093  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0050  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00823452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0052  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00638125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0121  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000163841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0032  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.272295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t028  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00444384  normal  0.0406037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t030  tRNA-Phe  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00416804  normal  0.0398749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0071  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0026  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.981393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0017  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0016  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4952  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5650  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000510114  normal  0.526212 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0269  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0022  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.45164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0020  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0014  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00079  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0014  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0733  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00229797  decreased coverage  0.0082117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t03  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4698  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5108  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4603  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000814099  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0101  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0037  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4281  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4333  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0560491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5068  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3111  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0206196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0079  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0011  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0083  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0161  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  95.83 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>