299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0191 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0193  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0260  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2156  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2770  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0250  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  96.77 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  96.77 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0010  tRNA-Phe  98.25 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5345  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000017112  hitchhiker  0.00000000000596861 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0145  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000807799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0043  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0149  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0067  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000000833232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0047  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0165  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0100  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000189649  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0032  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.272295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0109  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000406559  normal  0.781689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0087  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0032  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0093  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0030  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000136397  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t030  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00416804  normal  0.0398749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0025  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t100  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000153181  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0091  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0021  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000531965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0102  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000613191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0108  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000869293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0043  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000783978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0112  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0390211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0050  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00823452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0052  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00638125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0121  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000163841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t028  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00444384  normal  0.0406037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0105  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000135806  normal  0.713625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>