More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1258 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  90.31 
 
 		 265 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  90.59 
 
 		 263 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  67.45 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  67.06 
 
 		 262 aa  360  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  64.71 
 
 		 257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 260 aa  349  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  61.42 
 
 		 260 aa  340  9e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  63.05 
 
 		 251 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  58.89 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  62.55 
 
 		 262 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  61.35 
 
 		 255 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  62.15 
 
 		 262 aa  321  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  57.77 
 
 		 260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  57.77 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  55.95 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 		 256 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  55.82 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  54.66 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  54.62 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  53.73 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  53.73 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  52.96 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 260 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.16 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  55.16 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  55.38 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  54.76 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  55.42 
 
 		 284 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  52.96 
 
 		 260 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  53.31 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  53.31 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  51.78 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  54.98 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  53.33 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  52.38 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  48.82 
 
 		 253 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  48.43 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  51.98 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  55.23 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 268 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  51.59 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  51 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  49.4 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  55 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  50.59 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  51.34 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  51.78 
 
 		 271 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  53.17 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 270 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  49.02 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  49.41 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 274 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.84 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  51.38 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  51.18 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  48.02 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>