More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3230 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
260 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  97.69 
 
 
260 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  97.69 
 
 
260 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  68.38 
 
 
258 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  69.02 
 
 
260 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  66.14 
 
 
264 aa  362  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 
262 aa  361  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  65.22 
 
 
257 aa  361  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 
265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  63.92 
 
 
263 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 
258 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  63.49 
 
 
255 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  62.8 
 
 
262 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  61.6 
 
 
262 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  59.44 
 
 
251 aa  321  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  58.17 
 
 
260 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  57.77 
 
 
260 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  54.15 
 
 
256 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 
270 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  51.95 
 
 
258 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 
263 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
261 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
261 aa  284  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  52.34 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  53.91 
 
 
263 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  53.36 
 
 
258 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  51.79 
 
 
263 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 
258 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52.02 
 
 
259 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.02 
 
 
259 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  51.17 
 
 
260 aa  278  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
272 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
272 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
272 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
272 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
272 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
272 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  48.65 
 
 
273 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  50.39 
 
 
261 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  52.19 
 
 
253 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 
260 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  51 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  47.51 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 
260 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
261 aa  272  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 
260 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 
266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 
260 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  48.44 
 
 
260 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
269 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 
258 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
268 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
268 aa  268  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  51.95 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  47.43 
 
 
270 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  48.28 
 
 
275 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.84 
 
 
274 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  48.47 
 
 
272 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  49 
 
 
263 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  48.39 
 
 
284 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  48.19 
 
 
268 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  47.62 
 
 
260 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  51.81 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  51.81 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  51.81 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  49.41 
 
 
267 aa  261  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  48.62 
 
 
267 aa  261  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  47.45 
 
 
264 aa  261  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
268 aa  261  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 
260 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  50 
 
 
270 aa  261  8.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  48.5 
 
 
274 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
258 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  50.59 
 
 
254 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  49.04 
 
 
267 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
264 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
264 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
264 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
264 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
264 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 
274 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>