More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1301 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  95.82 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  90.59 
 
 		 258 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  68.36 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  63.92 
 
 		 260 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 		 262 aa  355  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  63.64 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  59.68 
 
 		 258 aa  334  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  60.32 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  60.96 
 
 		 262 aa  321  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  61.75 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  58.73 
 
 		 260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  58.73 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  58.1 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  55.6 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  54.66 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  55.24 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  55.77 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  55.38 
 
 		 270 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  56.13 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  56.9 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  55.2 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  53.57 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  54.47 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  55.56 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.56 
 
 		 261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  52.17 
 
 		 258 aa  281  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 		 258 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  56.05 
 
 		 284 aa  281  8.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  54.62 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52.16 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  53.36 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.16 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  52.82 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  53.36 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  52.99 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  54.37 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  52.96 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  53.57 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 269 aa  278  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  53.63 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  54.37 
 
 		 258 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  56.78 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  52.82 
 
 		 268 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  49.01 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  54.69 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  53.64 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51.59 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  50.6 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  48.22 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 260 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.59 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  52.57 
 
 		 271 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  53.15 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  52 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  51.75 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  53.15 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  52.76 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  52.59 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  52.78 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  49.8 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  51.78 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  51.78 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  51.78 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  51.78 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  51.78 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>