More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0884 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  99.23 
 
 		 260 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  97.69 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  68.09 
 
 		 260 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  67.98 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  65.75 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  65.22 
 
 		 257 aa  360  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 		 262 aa  360  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 		 265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 		 263 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 		 255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  62.8 
 
 		 262 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  61.6 
 
 		 262 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  58.96 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  58.57 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  54.15 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  51.95 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  53.78 
 
 		 263 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  51.95 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52.02 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.02 
 
 		 259 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  51.17 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  53.52 
 
 		 263 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 		 255 aa  278  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  52.96 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  50.39 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  48.28 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  51.39 
 
 		 263 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  51.79 
 
 		 253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  50.6 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 		 260 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 266 aa  271  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  48.44 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  52.34 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  49.4 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.43 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  47.04 
 
 		 270 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  47.89 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  48 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  47.62 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  48.09 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  48.62 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  50.39 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  49.01 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  47.98 
 
 		 284 aa  258  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  47.6 
 
 		 268 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  48.12 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  49.04 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  46.67 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>