More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1471 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 258 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  81.71 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  68.63 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  68.38 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  67.98 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  67.98 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  65.48 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  62.06 
 
 		 264 aa  341  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  64.26 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  59.68 
 
 		 263 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  58.89 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  58.89 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  58.1 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  57.31 
 
 		 262 aa  304  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  56.3 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  55.91 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  53.33 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  54.8 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  52.73 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  52.36 
 
 		 259 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  52.78 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  52.94 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  53.15 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  51.81 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  53.94 
 
 		 261 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  50.97 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  52.76 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  51.97 
 
 		 260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  52.16 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 260 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 261 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  52.55 
 
 		 266 aa  281  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 		 268 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  51.2 
 
 		 253 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  52.23 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  51.82 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  51.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  52.55 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  52.55 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  51.18 
 
 		 260 aa  278  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  53.88 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 261 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  51.61 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  52.23 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  52.38 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  50.19 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 268 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  51.57 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  51.57 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  50.78 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 		 268 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 284 aa  271  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  51.37 
 
 		 267 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  49.22 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  50.78 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  51.17 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  50.98 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1882  methionine aminopeptidase  49.22 
 
 		 272 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>