More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0269 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
255 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  76.89 
 
 
251 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  73.71 
 
 
262 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  70.92 
 
 
262 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  67.87 
 
 
257 aa  362  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  63.89 
 
 
264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  63.49 
 
 
260 aa  343  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 
260 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 
260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  62.06 
 
 
262 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  63.45 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  64.26 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  60.32 
 
 
263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  61.35 
 
 
258 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  60.4 
 
 
265 aa  321  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  56.75 
 
 
260 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  56.75 
 
 
260 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  50.2 
 
 
253 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 
256 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  49.8 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  54.92 
 
 
263 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 
263 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 
260 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 
261 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
261 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  50.82 
 
 
261 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  51.84 
 
 
263 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  51.2 
 
 
274 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 
258 aa  260  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 
270 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  52.46 
 
 
268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 
259 aa  258  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  49.41 
 
 
266 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  54.17 
 
 
268 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 
261 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  51.19 
 
 
269 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  50 
 
 
274 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  53.75 
 
 
268 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  48.02 
 
 
260 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 
260 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  53.75 
 
 
268 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  49.01 
 
 
264 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  51.84 
 
 
255 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  49.6 
 
 
254 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  49.6 
 
 
254 aa  255  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
266 aa  255  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 
258 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 
261 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  52.92 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  50.79 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  48.21 
 
 
260 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  53.33 
 
 
274 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  47.22 
 
 
260 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
275 aa  252  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  51.23 
 
 
263 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  48.22 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
268 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1434  methionine aminopeptidase  49.41 
 
 
272 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473966 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
271 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  46.83 
 
 
260 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 
271 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 
271 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 
271 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
258 aa  250  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 
271 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  51.67 
 
 
268 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 
271 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  48.22 
 
 
263 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  46.83 
 
 
260 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
270 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  48.81 
 
 
271 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
273 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
264 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  52.08 
 
 
272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  46.43 
 
 
264 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  46.43 
 
 
260 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6057  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
271 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2020  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
271 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2040  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
271 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  47.41 
 
 
260 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>