More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4592 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4592  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 251 aa  520  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000604875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0269  methionine aminopeptidase, type I  76.89 
 
 		 255 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0085  methionine aminopeptidase, type I  71.31 
 
 		 262 aa  387  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1178  methionine aminopeptidase, type I  67.87 
 
 		 262 aa  360  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2321  methionine aminopeptidase, type I  65.86 
 
 		 257 aa  357  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1365  methionine aminopeptidase, type I  62.25 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1500  methionine aminopeptidase, type I  62.65 
 
 		 262 aa  334  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1258  methionine aminopeptidase, type I  63.05 
 
 		 258 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  hitchhiker  0.00735984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1659  methionine aminopeptidase, type I  61.04 
 
 		 260 aa  331  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.343705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1471  methionine aminopeptidase, type I  59.84 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0884  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.208447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3138  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3230  methionine aminopeptidase, type I  59.44 
 
 		 260 aa  321  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.10973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4017  methionine aminopeptidase, type I  60.64 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1301  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.96893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  57.77 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  57.77 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  52.19 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  52.19 
 
 		 253 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  53.01 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  53.06 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  51.41 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  54.29 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  51.41 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 		 263 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  52.21 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  51.61 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  53.41 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  50.6 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  50.6 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  51.39 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  51.81 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  50.6 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  50.6 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 262 aa  248  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  50.8 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  49.8 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1277  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  50 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  51.25 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  46.53 
 
 		 265 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  50.83 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  50.83 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  48.57 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  49.2 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  48.8 
 
 		 271 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  50.42 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  47.6 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  45.38 
 
 		 264 aa  241  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  48.4 
 
 		 266 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  48.13 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  45.38 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  47.2 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 		 268 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 262 aa  237  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1256  methionine aminopeptidase  47.6 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>