More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0396 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
264 aa  552  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  99.24 
 
 
264 aa  550  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0557  methionine aminopeptidase, type I  84.91 
 
 
266 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.484124  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  68.25 
 
 
256 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  65.87 
 
 
260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  65.48 
 
 
260 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  65.48 
 
 
260 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  64.03 
 
 
260 aa  353  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  65.08 
 
 
260 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  65.08 
 
 
260 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  63.67 
 
 
260 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  64.82 
 
 
260 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  64 
 
 
261 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  64.03 
 
 
260 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  64 
 
 
261 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  62.65 
 
 
264 aa  345  6e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  62.89 
 
 
263 aa  344  8e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  64.4 
 
 
254 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  64.4 
 
 
254 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  61.02 
 
 
262 aa  342  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  62.2 
 
 
270 aa  335  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  62.2 
 
 
258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  62 
 
 
258 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  61.11 
 
 
255 aa  332  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  60.8 
 
 
261 aa  332  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 
258 aa  332  5e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  59.6 
 
 
258 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  327  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  59.52 
 
 
264 aa  325  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  58.8 
 
 
259 aa  325  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  58.8 
 
 
259 aa  323  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  59.59 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  55.95 
 
 
264 aa  317  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  56.75 
 
 
264 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  56.35 
 
 
263 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  58.8 
 
 
266 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  56.35 
 
 
263 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  56.75 
 
 
264 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  58.54 
 
 
255 aa  315  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  61.22 
 
 
285 aa  309  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  55.51 
 
 
270 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  56.05 
 
 
261 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  57.37 
 
 
267 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 
261 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  56.45 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  59.2 
 
 
267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  57.54 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  56.92 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  54.37 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  58.4 
 
 
267 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  54.76 
 
 
264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  55.21 
 
 
269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  55.21 
 
 
269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  58.5 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  56.3 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  57.26 
 
 
263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  58.8 
 
 
267 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  55.82 
 
 
261 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  54.18 
 
 
264 aa  298  5e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  54.44 
 
 
280 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  55.6 
 
 
284 aa  297  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  54.33 
 
 
263 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  56.08 
 
 
262 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  56.18 
 
 
260 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  56.6 
 
 
275 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  56.13 
 
 
253 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  55.2 
 
 
269 aa  294  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  54 
 
 
270 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  53.97 
 
 
268 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  53.97 
 
 
268 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1403  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
275 aa  291  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  53.57 
 
 
268 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  53.57 
 
 
268 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2146  peptidase M24A  52.16 
 
 
263 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00623743  normal  0.0449279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 
268 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2362  methionine aminopeptidase, type I  52.16 
 
 
263 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  53.82 
 
 
277 aa  288  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  51.75 
 
 
265 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2584  methionine aminopeptidase  54.51 
 
 
271 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1341  methionine aminopeptidase  53.78 
 
 
274 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 
268 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  54.51 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  54.1 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  54.51 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  54.51 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  54.51 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>