89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3926 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  100 
 
 		 150 aa  299  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  96 
 
 		 150 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  95.33 
 
 		 150 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  87.33 
 
 		 150 aa  264  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  71.92 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  69.86 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  69.86 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  69.78 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  63.7 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  63.7 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  31.39 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1544  flagellar export protein FliJ  34.81 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  31.62 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2395  flagellar biosynthesis chaperone  28.78 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.437511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2294  flagellar biosynthesis chaperone  28.78 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  28.15 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2010  flagellar biosynthesis chaperone  28.78 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  29.71 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  35.77 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0394  flagellar protein  29.93 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  37.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2579  flagellar biosynthesis chaperone  32.85 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  28.08 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  28.08 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  27.74 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.919883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1706  flagellar export protein FliJ  29.1 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  31.11 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  34.56 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.61 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2533  flagellar biosynthesis chaperone  28.36 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  31.11 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1700  flagellar biosynthesis chaperone  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1242  flagellar biosynthesis chaperone  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2175  flagellar biosynthesis chaperone  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0416512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2042  flagellar biosynthesis chaperone  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2184  flagellar protein FliJ, putative  34.06 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  31.11 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2718  flagellar biosynthesis chaperone  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482676  normal  0.686371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.74 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1965  flagellar export protein FliJ  30.56 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  31.11 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  27.27 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  31.11 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1887  flagellar biosynthesis chaperone  32.85 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  26.5 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1993  flagellar export protein FliJ  32.37 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  29.63 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  25.55 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  27.01 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  30.77 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  27.01 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  29.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  28.47 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  27.01 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1269  flagellar biosynthesis chaperone  27.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1146  flagellar biosynthesis chaperone  27.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.865391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2131  flagellar biosynthesis chaperone  27.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2189  flagellar biosynthesis chaperone  27.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2136  flagellar biosynthesis chaperone  27.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.7 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  25.37 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  25.76 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4172  flagellar export protein FliJ  33.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00977  flagellar export protein FliJ  28.57 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06189  flagellar export protein FliJ  28.57 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0456283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0713  flagellar export protein FliJ  34.06 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893242  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  27.41 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  25 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  27.27 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2355  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.66 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0569  flagellar biosynthesis chaperone  34.67 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4391  flagellar export protein FliJ  28.35 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  26.09 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1020  flagellar export protein FliJ  29.9 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  29.58 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  25.76 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1604  flagellar protein FliJ  30.19 
 
 		 149 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1438  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  23.74 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  25.74 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1876  flagellar export protein FliJ  26.09 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.290695  normal  0.367197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  25 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  25 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  25 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>