62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2304 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  100 
 
 
145 aa  296  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  65.52 
 
 
147 aa  203  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  65.52 
 
 
147 aa  201  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  62.94 
 
 
147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  34.53 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  33.85 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  36.89 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  33.08 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  32.31 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  31.65 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  30.66 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  30.66 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  30.66 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  29.41 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  32.03 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  30.66 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  31.88 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  30 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  30.88 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  32.35 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  30.77 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02885  Flagellar biosynthesis chaperone  32.04 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0337706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  23.74 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  26.5 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  23.62 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  24.43 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  27.18 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  26.5 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  24.41 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  23.02 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  22.3 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  22.3 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  23.02 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  23.02 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  23.02 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  23.36 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  25.78 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  25.78 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  22.9 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25.52 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  29.17 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  29.17 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  23.48 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  25.64 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  21.54 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  22.55 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1438  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1993  flagellar export protein FliJ  22.22 
 
 
147 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  21.54 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  24.81 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  21.82 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  28.57 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  20.14 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  23.08 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  21.26 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4172  flagellar export protein FliJ  21.17 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>