59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02885 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02885  Flagellar biosynthesis chaperone  100 
 
 
148 aa  293  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0337706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  52.78 
 
 
146 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  43.7 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  43.64 
 
 
148 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  43.4 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  38.76 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  38.03 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  41.51 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  43.22 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  38.98 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  38.98 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  38.98 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  37.61 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  38.14 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  35.92 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  41.53 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  39.62 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  37.96 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  40.74 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  29.25 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  27.7 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  28.17 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  33.02 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  33.04 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  25.69 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.78 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  26.06 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  32.09 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2579  flagellar biosynthesis chaperone  33.33 
 
 
148 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  27.73 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1887  flagellar biosynthesis chaperone  33.33 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2355  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.68 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  30.51 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  29.17 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2294  flagellar biosynthesis chaperone  27.83 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2010  flagellar biosynthesis chaperone  27.83 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  26.47 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  27.68 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  27.68 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  28.16 
 
 
152 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  29.31 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2395  flagellar biosynthesis chaperone  27.83 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.437511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  25.9 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25.76 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  28.32 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  28.32 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  28.57 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1965  flagellar export protein FliJ  24.82 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  28.24 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  28.24 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  27.18 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1438  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  23.61 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2533  flagellar biosynthesis chaperone  26.67 
 
 
147 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>