74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1506 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  100 
 
 
147 aa  296  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  36.43 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02885  Flagellar biosynthesis chaperone  38.03 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0337706  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  37.24 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  37.32 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  35.97 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  36.62 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  35.97 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  36.55 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  34.53 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  36.55 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  34.27 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  34.62 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  34.62 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  30 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  34.62 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  34.62 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  34.97 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  29.79 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  33.08 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  35.77 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  32.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  34.23 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  30.71 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.09 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2136  flagellar biosynthesis chaperone  29.82 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2189  flagellar biosynthesis chaperone  29.82 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.589182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2131  flagellar biosynthesis chaperone  29.82 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1146  flagellar biosynthesis chaperone  29.82 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.865391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1269  flagellar biosynthesis chaperone  29.82 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  28.46 
 
 
149 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1544  flagellar export protein FliJ  28.04 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  29.55 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  29.55 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  27.94 
 
 
165 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2579  flagellar biosynthesis chaperone  26.52 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  31 
 
 
156 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2533  flagellar biosynthesis chaperone  28.95 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  26.32 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  26.32 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  27.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  26.12 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  26.32 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2718  flagellar biosynthesis chaperone  28.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482676  normal  0.686371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1887  flagellar biosynthesis chaperone  26.52 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2294  flagellar biosynthesis chaperone  27.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1242  flagellar biosynthesis chaperone  28.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615597  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1700  flagellar biosynthesis chaperone  28.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2010  flagellar biosynthesis chaperone  27.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2175  flagellar biosynthesis chaperone  28.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0416512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2042  flagellar biosynthesis chaperone  28.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1706  flagellar export protein FliJ  28.07 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  26.32 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  27.19 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  25.56 
 
 
150 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2395  flagellar biosynthesis chaperone  28.21 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.437511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  25.76 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2355  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.58 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  25.76 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4172  flagellar export protein FliJ  25.9 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  30 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  29.91 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  22.73 
 
 
154 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  22.73 
 
 
154 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0394  flagellar protein  22.73 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137594  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  20.9 
 
 
149 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  26.09 
 
 
148 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  25.22 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>