86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0394 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0394  flagellar protein  100 
 
 		 155 aa  314  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  81.82 
 
 		 154 aa  254  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  81.82 
 
 		 154 aa  254  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  41.1 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  37.84 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  37.84 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  37.84 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  37.84 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  38.03 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  37.41 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  37.32 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  39.72 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  35.21 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  35.92 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1604  flagellar protein FliJ  33.58 
 
 		 149 aa  87.8  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  31.94 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  31.25 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  30.77 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  33.82 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4172  flagellar export protein FliJ  34.9 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2579  flagellar biosynthesis chaperone  32.61 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  33.83 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1887  flagellar biosynthesis chaperone  32.61 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  31.06 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2395  flagellar biosynthesis chaperone  31.06 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.437511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2010  flagellar biosynthesis chaperone  31.06 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2294  flagellar biosynthesis chaperone  31.06 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1544  flagellar export protein FliJ  30.3 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  30.5 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.54 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  31.94 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  30.56 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  33.83 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  29.93 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  33.83 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1146  flagellar biosynthesis chaperone  29.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.865391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2136  flagellar biosynthesis chaperone  29.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2189  flagellar biosynthesis chaperone  29.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2131  flagellar biosynthesis chaperone  29.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1269  flagellar biosynthesis chaperone  29.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  30.43 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1706  flagellar export protein FliJ  29.55 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  30.43 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2533  flagellar biosynthesis chaperone  28.79 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2042  flagellar biosynthesis chaperone  28.79 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2175  flagellar biosynthesis chaperone  28.79 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0416512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1242  flagellar biosynthesis chaperone  28.79 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1700  flagellar biosynthesis chaperone  28.79 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2718  flagellar biosynthesis chaperone  28.79 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482676  normal  0.686371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  29.93 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  29.93 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  29.93 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  29.37 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  28.97 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  29.13 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  27.97 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  30.07 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  30.07 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  30.07 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  28.67 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  30.07 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1438  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  29.25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  26.52 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  26.24 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  26.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1395  flagellar export protein FliJ  25 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  29.03 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  28.06 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  29.03 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  28.23 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0713  flagellar export protein FliJ  32.65 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893242  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  28.23 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3803  flagellar export protein FliJ  25.56 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3077  flagellar export protein FliJ  25.56 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0437  flagellar FliJ protein  29.13 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00162902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  25 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  22.73 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1993  flagellar export protein FliJ  29.33 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2355  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25.42 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>