86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3062 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  85.14 
 
 		 148 aa  257  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  75 
 
 		 148 aa  218  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  67.57 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  64.86 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  64.19 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  63.45 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  64.19 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  64.19 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  64.63 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  62.07 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  64.83 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  64.83 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  62.59 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  64.14 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  63.45 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  30.94 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02885  Flagellar biosynthesis chaperone  40 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0337706  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  31.65 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  34.97 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  32.39 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  30.34 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  36.43 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  29.58 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  30.94 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.14 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2951  flagellar biosynthesis chaperone  33.81 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  28.57 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2294  flagellar biosynthesis chaperone  33.09 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2010  flagellar biosynthesis chaperone  33.09 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2395  flagellar biosynthesis chaperone  33.09 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.437511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  35.29 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2579  flagellar biosynthesis chaperone  31.03 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.153139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  34.56 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1887  flagellar biosynthesis chaperone  31.03 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  27.86 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  29.55 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  30.71 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2533  flagellar biosynthesis chaperone  28.97 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0394  flagellar protein  29.37 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2189  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.589182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1544  flagellar export protein FliJ  31.51 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1269  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1146  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.865391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2131  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2136  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  30.71 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  28.03 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  28.03 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  30 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  27.27 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  30 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  26.43 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  30 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  27.27 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  30.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1706  flagellar export protein FliJ  29.05 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  28.57 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4172  flagellar export protein FliJ  30.14 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  29.29 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  28.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2042  flagellar biosynthesis chaperone  28.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1242  flagellar biosynthesis chaperone  28.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2175  flagellar biosynthesis chaperone  28.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0416512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1700  flagellar biosynthesis chaperone  28.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  30 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  27.41 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2718  flagellar biosynthesis chaperone  28.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482676  normal  0.686371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1604  flagellar protein FliJ  28.57 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  28.57 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  28.57 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  25.76 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  25.76 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1993  flagellar export protein FliJ  24.14 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  29.66 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  22.86 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  22.86 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1720  flagellar protein FliJ  25.17 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  25.52 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1720  hypothetical protein  25.17 
 
 		 151 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>