48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3043 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3043  flagellar export protein FliJ  100 
 
 		 146 aa  290  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02885  Flagellar biosynthesis chaperone  52.78 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0337706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1506  flagellar protein FliJ  36.43 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2293  flagellar protein FliJ  43.52 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.919883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1365  flagellar export protein FliJ  40.54 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1328  flagellar export FliJ  39.64 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.843025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1286  flagellar export protein FliJ  38.74 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1346  flagellar export protein FliJ  38.53 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1353  flagellar export protein FliJ  38.53 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2922  flagellar export protein FliJ  38.89 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3224  flagellar protein FliJ  38.53 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3064  flagellar export protein FliJ  38.89 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543016  normal  0.584874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2932  flagellar export protein FliJ  38.89 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1622  flagellar export protein FliJ  38.74 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1441  flagellar export protein FliJ  38.89 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.707873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2572  flagellar export protein FliJ  37.61 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1186  flagellar export protein FliJ  37.84 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3062  flagellar export protein FliJ  36.43 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1370  flagellar export protein FliJ  41.28 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2304  flagellar biosynthesis chaperone  27.18 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1713  flagellar biosynthesis chaperone  27.27 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002819  flagellar protein FliJ  27.03 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  27.66 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  30.63 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  30.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  34.48 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1965  flagellar export protein FliJ  28.21 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03158  flagellar biosynthesis chaperone  27.19 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  34.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  29.58 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  27.93 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  26.8 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  29.45 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  27.93 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  27.93 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  26.8 
 
 		 147 aa  40.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  25.69 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1993  flagellar export protein FliJ  29.66 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  28.08 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1438  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  26.79 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>