35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1876 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1876  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
155 aa  303  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.290695  normal  0.367197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06189  flagellar export protein FliJ  74.83 
 
 
150 aa  202  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0456283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00977  flagellar export protein FliJ  74.83 
 
 
150 aa  202  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  34.01 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  34.48 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  26.81 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  30.56 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1965  flagellar export protein FliJ  30.99 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  34.04 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0554  flagellar export FliJ  31.16 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  31.03 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  31.11 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  31.11 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  31.11 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  26.21 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  26.21 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  26.81 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  33.09 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.62 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2355  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.88 
 
 
150 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  29.2 
 
 
147 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  25.53 
 
 
151 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  26.09 
 
 
150 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  30.88 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.56 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0713  flagellar export protein FliJ  31.96 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893242  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  26.09 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  30.88 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  29.2 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0139652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>