20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4391 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4391  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3077  flagellar export protein FliJ  66.67 
 
 
154 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3803  flagellar export protein FliJ  66.67 
 
 
154 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0642  flagellar export protein FliJ  53.47 
 
 
154 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0554  flagellar export FliJ  42.14 
 
 
155 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1117  flagellar export protein FliJ  47.52 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0569  flagellar biosynthesis chaperone  34.55 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1020  flagellar export protein FliJ  33.58 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  29.1 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  33.33 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  29.92 
 
 
149 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  29.37 
 
 
150 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  28.35 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  28.57 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  28.35 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  27.52 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  28.35 
 
 
149 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  28.35 
 
 
149 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  31.01 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  30 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0229803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>