18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2184 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2184  flagellar protein FliJ, putative  100 
 
 		 143 aa  286  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  35.77 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  33.33 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  33.33 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  34.78 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  34.78 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.573361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  32.61 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3926  flagellar biosynthesis chaperone  34.06 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3690  flagellar biosynthesis chaperone  32.61 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1438  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  29.1 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  36.76 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  36.03 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  29.41 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1974  flagellar export FliJ  27.69 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  27.01 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0769  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  26.28 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.635928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00977  flagellar export protein FliJ  28.47 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06189  flagellar export protein FliJ  28.47 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0456283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>