193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1376 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  100 
 
 		 161 aa  323  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0090  rubrerythrin  76.62 
 
 		 160 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  77.33 
 
 		 165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  70 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2317  rubrerythrin/nigerythrin-like protein  71.13 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.78 
 
 		 237 aa  130  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 		 237 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  44.58 
 
 		 237 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.34 
 
 		 235 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 		 237 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  44.65 
 
 		 238 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  43.59 
 
 		 237 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  42.77 
 
 		 243 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  41.18 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  48.06 
 
 		 139 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  42.31 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  40 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  38.75 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  42.31 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  40.65 
 
 		 139 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  42.75 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  45.04 
 
 		 139 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  45.04 
 
 		 139 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  45.04 
 
 		 139 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  43.41 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  38.71 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  39.61 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  38.96 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  40.26 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  40.52 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  39.87 
 
 		 140 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  44.96 
 
 		 140 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  43.62 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  38.06 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  38.96 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  40.98 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  39.61 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  38.31 
 
 		 140 aa  84.3  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  40.65 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  44.44 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  42.86 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  42.98 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  41.33 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  40.65 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.64 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  40.54 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  38.93 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  39.73 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  39.33 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  45.92 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  43.65 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  41.13 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  40.54 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  50.51 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  42.15 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  50 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  45.37 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  33.78 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  37.58 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  41.32 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  44.55 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.8 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  41.32 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  48.96 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  36.99 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.02 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  48.04 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  36.24 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  46.94 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  33.53 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  38.41 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  39.6 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  39.86 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  42 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  39.84 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  41.18 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  40.32 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  41.73 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  39.84 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  41.46 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  34.76 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  38.84 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  37.82 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  37.58 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  38.51 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  38.17 
 
 		 191 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  38.06 
 
 		 190 aa  70.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  32.34 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>