192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0090 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0090  rubrerythrin  100 
 
 		 160 aa  320  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  88.39 
 
 		 165 aa  277  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  76.62 
 
 		 161 aa  243  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  69.13 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2317  rubrerythrin/nigerythrin-like protein  65.33 
 
 		 157 aa  196  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  44.94 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.57 
 
 		 237 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 		 237 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  42.41 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.77 
 
 		 237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  43.67 
 
 		 243 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.25 
 
 		 235 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  42.33 
 
 		 237 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  45.77 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  45.8 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  41.48 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  38.46 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  40 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  37.01 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  40.5 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.41 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  39.85 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  42.15 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  42.86 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  44.19 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  43.08 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  42.57 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  43.08 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  43.08 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  37.42 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  39.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  40.5 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  37.91 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.31 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  42.28 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  44.19 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  37.25 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  36.6 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  45.92 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  37.25 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  37.25 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  44.72 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  37.25 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  37.25 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  37.25 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  43.41 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  43.2 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  36.77 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.31 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  36.6 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  42.4 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  39.47 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  36.6 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  42.4 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  36.77 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  35.95 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  47.47 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  40 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  40 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  43.8 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  43 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  39.73 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  43.33 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  43.24 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  36.05 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  40 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  42.52 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  38.16 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  42.52 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  38.28 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  40.8 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  41.44 
 
 		 202 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.02 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  41 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  43.88 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  36.8 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  37.6 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  38.98 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  43.16 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  40.94 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  35.21 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  41.27 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  36.8 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.62 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.3 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  44.9 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  40.57 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  42.64 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  36.97 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  35.66 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  39.55 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  45.45 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  47.92 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>