219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4992 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4992  replicative DNA helicase  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0781  replicative DNA helicase  53.19 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4814  replicative DNA helicase  54.66 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1072  replicative DNA helicase  48.29 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.94401  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  30.3 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  31.73 
 
 		 473 aa  61.6  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  30.35 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  28.42 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0849  replicative DNA helicase  25.38 
 
 		 431 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  26 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0983  replicative DNA helicase  27.41 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  29.47 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0832  replicative DNA helicase  29.19 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  30.98 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_002978  WD0354  replicative DNA helicase  28.44 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  29.79 
 
 		 585 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  29.85 
 
 		 450 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0739  replicative DNA helicase  25.93 
 
 		 463 aa  55.5  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  27.46 
 
 		 461 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0840  replicative DNA helicase  24.87 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.337638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1111  replicative DNA helicase  26.18 
 
 		 428 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.229668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4330  replicative DNA helicase  26.53 
 
 		 429 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.115603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2068  DnaB helicase  28.96 
 
 		 466 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  27.14 
 
 		 437 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0880  replicative DNA helicase  24.87 
 
 		 431 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1024  replicative DNA helicase  25.65 
 
 		 428 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.916130000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  27.62 
 
 		 456 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0934  replicative DNA helicase  24.87 
 
 		 428 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  24.26 
 
 		 470 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf690  replicative DNA helicase  30 
 
 		 487 aa  53.9  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0607  replicative DNA helicase  29.29 
 
 		 453 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  28.49 
 
 		 874 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  28.65 
 
 		 466 aa  52.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0357  replicative DNA helicase  28.04 
 
 		 465 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.973101 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  28.57 
 
 		 447 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  28.22 
 
 		 444 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1028  replicative DNA helicase  26.18 
 
 		 428 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  26.56 
 
 		 448 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  29.57 
 
 		 448 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  26.88 
 
 		 464 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  27.75 
 
 		 455 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  23.53 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  23.53 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  25 
 
 		 459 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0571  replicative DNA helicase  25.94 
 
 		 488 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  28.79 
 
 		 464 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0451  replicative DNA helicase  26.42 
 
 		 488 aa  51.6  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  26.23 
 
 		 456 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf761  bacteriophage MAV1 replication protein RepB  27.27 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  23.96 
 
 		 485 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  27.27 
 
 		 450 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  29.15 
 
 		 441 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  27.43 
 
 		 512 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3562  DnaB domain protein helicase domain protein  27.03 
 
 		 479 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  28.35 
 
 		 444 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  28.72 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0079  primary replicative DNA helicase  28.91 
 
 		 473 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.533347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  27.08 
 
 		 452 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  26.2 
 
 		 610 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  28.78 
 
 		 444 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  28.78 
 
 		 439 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0097  replicative DNA helicase  28.91 
 
 		 473 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.100227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0085  replicative DNA helicase  28.91 
 
 		 473 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0078  replicative DNA helicase  29.5 
 
 		 474 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149462  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  26.2 
 
 		 455 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  26.2 
 
 		 610 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  28.09 
 
 		 445 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  27.27 
 
 		 471 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  27.17 
 
 		 444 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0637  replicative DNA helicase  24.87 
 
 		 436 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0562  replicative DNA helicase  24.87 
 
 		 440 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.229469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  24.24 
 
 		 473 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0931  replicative DNA helicase  25.95 
 
 		 470 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000071326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  27.17 
 
 		 444 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  27.08 
 
 		 452 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  27 
 
 		 445 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  25.91 
 
 		 456 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  28.42 
 
 		 447 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  28.27 
 
 		 514 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  25.62 
 
 		 442 aa  48.5  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4115  replicative DNA helicase  26.84 
 
 		 451 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  27.42 
 
 		 454 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl084  DNA replication priming helicase  26.47 
 
 		 448 aa  48.5  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  26.98 
 
 		 460 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  27.87 
 
 		 460 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  27.23 
 
 		 441 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  25.95 
 
 		 454 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  26.88 
 
 		 454 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  27.23 
 
 		 456 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  24.6 
 
 		 476 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  27.13 
 
 		 456 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  26.73 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  27.8 
 
 		 470 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  27.5 
 
 		 457 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  27.5 
 
 		 457 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  25.93 
 
 		 481 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1662  replicative DNA helicase  26.26 
 
 		 445 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000265874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3611  replicative DNA helicase  23.81 
 
 		 440 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  25.95 
 
 		 457 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15351  replicative DNA helicase  26.8 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>