More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2481 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2481  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 193 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13441  isochorismatase hydrolase family protein  40.31 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14270  isochorismatase family hydrolase  43.26 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.502198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1266  hypothetical protein  42.7 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3537  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 180 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0372  isochorismatase hydrolase  42.77 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1181  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2225  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1932  hypothetical protein  39.08 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00511783  normal  0.127352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  40.88 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2514  hypothetical protein  37.43 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2418  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010109 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  38.73 
 
 		 178 aa  124  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1889  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289639  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07441  isochorismatase hydrolase family protein  34.55 
 
 		 206 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1819  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 176 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.758957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0076  isochorismatase family hydrolase  33.91 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.628185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2097  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  38.8 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2323  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.86531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0893  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.841822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0055  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154479  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0649  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1796  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  34.41 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2137  hydrolase, isochorismatase family  38.33 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1824  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2169  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2171  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2015  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.278156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0832  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2535  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3242  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300131  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  33.7 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3202  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1659  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3363  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0264  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.277622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2994  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0484  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0845  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.052747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06991  isochorismatase hydrolase family protein  32.18 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00402227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0525  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3967  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3533  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0590  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2828  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1406  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000957068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  33.14 
 
 		 180 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2804  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.135353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2854  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0796  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0658233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3651  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0134115  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  34.08 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3833  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.0266799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1609  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3806  isochorismatase superfamily hydrolase  40.35 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0876  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3709  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07021  isochorismatase hydrolase family protein  38.46 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2871  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2085  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1800  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4027  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101085  normal  0.863043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2110  isochorismatase hydrolase  38.6 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0762  isochorismatase family protein  33.53 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  36.88 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2647  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3089  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1763  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  31.98 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2119  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27696  predicted protein  32.76 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1002  isochorismatase family protein  32.07 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0600585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0978  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 180 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.626814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3409  isochorismatase family protein  32.24 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0966  hypothetical protein  34.09 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1402  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0644  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000874814  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06066  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08950)  31.67 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003058  isochorismatase  35.43 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.621303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1963  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0784919  normal  0.214151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0917  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0936  hypothetical protein  34.09 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0529  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0932  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.458462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3477  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0109114  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0860  isochorismatase family protein  32.42 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.9493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>