231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0076 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0076  isochorismatase family hydrolase  100 
 
 
203 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.628185  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06991  isochorismatase hydrolase family protein  96.06 
 
 
203 aa  358  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00402227  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07441  isochorismatase hydrolase family protein  46.77 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  44.97 
 
 
188 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  46.15 
 
 
188 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13441  isochorismatase hydrolase family protein  39.55 
 
 
209 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  46 
 
 
189 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0484  isochorismatase hydrolase  38.64 
 
 
182 aa  134  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07021  isochorismatase hydrolase family protein  42.14 
 
 
146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
180 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0525  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 
180 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0529  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 
180 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2481  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
193 aa  121  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0462  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0644  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 
180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000874814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  32.79 
 
 
181 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4027  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101085  normal  0.863043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2871  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
183 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1932  hypothetical protein  34.86 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00511783  normal  0.127352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  33.52 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2225  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2097  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
192 aa  111  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0055  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
180 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154479  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2804  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
187 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.135353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
189 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1406  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
187 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000957068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2930  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
188 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
200 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
178 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  31.43 
 
 
182 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2535  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
185 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2418  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.010109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1002  isochorismatase family protein  31.43 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0600585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2564  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
187 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00703707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0876  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
186 aa  98.6  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0860  isochorismatase family protein  34.48 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.9493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
185 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14270  isochorismatase family hydrolase  30.95 
 
 
180 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.502198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1609  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1266  hypothetical protein  30.36 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3709  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 
180 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
189 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3477  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
194 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0109114  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1889  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
176 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1800  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
207 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2514  hypothetical protein  29.65 
 
 
186 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0832  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3202  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
184 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2119  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2828  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1824  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3833  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
180 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.0266799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1819  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
176 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.758957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2015  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 
204 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.278156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3651  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0134115  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0796  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0658233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3409  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0917  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1181  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0845  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.052747  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2171  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1763  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
179 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2647  isochorismatase hydrolase  26.73 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2854  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0649  isochorismatase family protein  31.61 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3242  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3967  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0893  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.841822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2169  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3363  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0590  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1721  isochorismatase superfamily hydrolase  29.71 
 
 
167 aa  85.5  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2110  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 
183 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003058  isochorismatase  31.61 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.621303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3806  isochorismatase superfamily hydrolase  31.18 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01180  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 
287 aa  84  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01300  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2323  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.86531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1659  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3533  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2085  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557317  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27696  predicted protein  27.87 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0966  hypothetical protein  30.41 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06066  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08950)  27.93 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0264  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.277622  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5202  hypothetical protein  28.66 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1796  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2137  hydrolase, isochorismatase family  25.57 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3537  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02796  hypothetical protein  27.59 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0936  hypothetical protein  30.41 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0932  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.458462  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0762  isochorismatase family protein  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>