187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0372 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0372  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2514  hypothetical protein  46.24 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2994  isochorismatase hydrolase  48.04 
 
 		 181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1819  isochorismatase hydrolase  47.09 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.758957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1889  isochorismatase hydrolase  45.93 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289639  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1181  isochorismatase hydrolase  44.77 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2828  isochorismatase hydrolase  40.39 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1824  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3967  isochorismatase hydrolase  41 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2323  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 		 200 aa  151  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.86531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2169  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2015  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.278156 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2481  isochorismatase hydrolase  42.77 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5202  hypothetical protein  43.75 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1800  isochorismatase hydrolase  39.81 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0264  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.277622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2647  isochorismatase hydrolase  37.86 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1266  hypothetical protein  41.14 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14270  isochorismatase family hydrolase  40.57 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.502198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2171  isochorismatase hydrolase  40.88 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4027  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101085  normal  0.863043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0055  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154479  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3537  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2418  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1659  isochorismatase hydrolase  39.43 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3409  isochorismatase family protein  31.35 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02796  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1609  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1796  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2137  hydrolase, isochorismatase family  35.06 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0860  isochorismatase family protein  32.6 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.9493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003058  isochorismatase  31.49 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.621303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2119  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2871  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1763  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0876  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0966  hypothetical protein  35.43 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2535  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3242  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300131  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1932  hypothetical protein  35.39 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00511783  normal  0.127352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  31.46 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0525  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3806  isochorismatase superfamily hydrolase  34.66 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13441  isochorismatase hydrolase family protein  33.33 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2110  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0936  hypothetical protein  34.86 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  32.02 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  31.32 
 
 		 180 aa  90.9  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2225  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1721  isochorismatase superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  31.32 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0649  isochorismatase family protein  29.83 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3202  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3363  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2085  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0590  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  32.39 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1963  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0784919  normal  0.214151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0484  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1402  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0462  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3533  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0529  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0893  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.841822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3833  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.0266799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3709  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3651  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0134115  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0762  isochorismatase family protein  30.22 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0796  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0658233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0644  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000874814  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  31.45 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2097  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0845  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.052747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07441  isochorismatase hydrolase family protein  30.43 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0978  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.626814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0932  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.458462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0832  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1406  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000957068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2804  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.135353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07021  isochorismatase hydrolase family protein  32.41 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2854  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06066  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08950)  28.33 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01180  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3089  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27696  predicted protein  25.99 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3477  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0109114  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06991  isochorismatase hydrolase family protein  28.81 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00402227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>