260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0762 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0762  isochorismatase family protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3363  isochorismatase hydrolase  91.67 
 
 		 180 aa  343  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0590  isochorismatase hydrolase  91.67 
 
 		 180 aa  343  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3533  isochorismatase hydrolase  92.22 
 
 		 180 aa  342  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3833  isochorismatase hydrolase  83.33 
 
 		 180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.0266799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3709  isochorismatase hydrolase  82.78 
 
 		 180 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3651  isochorismatase hydrolase  82.78 
 
 		 180 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0134115  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0796  isochorismatase hydrolase  81.67 
 
 		 180 aa  305  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0658233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3242  isochorismatase hydrolase  80 
 
 		 180 aa  293  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0649  isochorismatase family protein  68.89 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0893  isochorismatase hydrolase  67.22 
 
 		 180 aa  257  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.841822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0832  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 180 aa  254  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0978  isochorismatase hydrolase  63.33 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.626814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0845  isochorismatase hydrolase  64.44 
 
 		 180 aa  238  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.052747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0932  isochorismatase hydrolase  61.67 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.458462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2854  isochorismatase hydrolase  62.22 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1270  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0525  isochorismatase hydrolase  43.33 
 
 		 180 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0462  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0168  isochorismatase superfamily hydrolase  43.89 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0644  isochorismatase hydrolase  43.89 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000874814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1609  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0529  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1656  isochorismatase superfamily hydrolase  41.67 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.579456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0860  isochorismatase family protein  42.22 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.9493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02796  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3409  isochorismatase family protein  41.53 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  41.95 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0484  isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2119  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003058  isochorismatase  41.11 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.621303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1763  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2963  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3202  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1406  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000957068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2804  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.135353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1002  isochorismatase family protein  39.01 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  38.95 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2930  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  36.67 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0055  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.154479  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0876  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0917  isochorismatase hydrolase  42.31 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2871  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2564  isochorismatase hydrolase  39.01 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2481  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2097  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  36.52 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1932  hypothetical protein  37.21 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00511783  normal  0.127352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1889  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0669  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3477  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0109114  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2225  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1819  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.758957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13441  isochorismatase hydrolase family protein  33.15 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3537  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  34.5 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0310  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1402  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1181  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2535  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07441  isochorismatase hydrolase family protein  27.22 
 
 		 206 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2514  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4027  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101085  normal  0.863043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5202  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2323  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.86531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3967  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3089  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2994  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01180  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  32.72 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2085  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1659  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27696  predicted protein  28.8 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.042891  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1824  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14270  isochorismatase family hydrolase  30.06 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.502198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0076  isochorismatase family hydrolase  30.9 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.628185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2169  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2418  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3806  isochorismatase superfamily hydrolase  32.2 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2015  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.278156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1721  isochorismatase superfamily hydrolase  29.38 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2110  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2171  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06066  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08950)  31.82 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2647  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06991  isochorismatase hydrolase family protein  29.78 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00402227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1266  hypothetical protein  29.48 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0936  hypothetical protein  33.9 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0372  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0966  hypothetical protein  33.9 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1800  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2828  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>