187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0177 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0177  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.69 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  35.63 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.93 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.79 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.77 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.45 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.7 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.68 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.75 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.97 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.68 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.68 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  35.9 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
139 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.19 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.95 
 
 
133 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.95 
 
 
133 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.2 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  28.83 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.51 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0688  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.53 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.5 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  23.2 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1024  ATP synthase F1, epsilon subunit  25.21 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  29.92 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.92 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.83 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18391  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  23.39 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  32.91 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.91 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0904  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.25 
 
 
171 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.112177  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.92 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0971  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.16 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.45 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.16 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.8 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.49 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  30.38 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.97 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.16 
 
 
139 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
133 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.83 
 
 
135 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.51 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.75 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.16 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.12 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.33 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.82 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.1 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.73 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1837  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  41.38 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1637  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.46 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.16 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2053  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.41 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.26 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>