More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1024 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1024  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.92 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.93 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.9 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.45 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.87 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.68 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.61 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1523  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.36 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000221531  unclonable  1.83775e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.71 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.06 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.7 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.37 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.51 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.71 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.7 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.82 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.8 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.75 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.42 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.66 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.29 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.24 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.61 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.9 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.57 
 
 
86 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.75 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.74 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.93 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.08 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.29 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.24 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.58 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.9 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.74 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.28 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2604  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  37.5 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000410324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.36 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08190  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  31.4 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.62 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.36 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.36 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.57 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3965  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.25 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000264026  normal  0.273139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.73 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.88 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.73 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.14 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2164  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.72 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.63 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.91 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.37 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0666  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  32.18 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.177829  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  41.43 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.1 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  34.51 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.68 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5598  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.74 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5120  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2337  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.11 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000264962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  32 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.51 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.72 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.68 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.72 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>