254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1637 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1637  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
146 aa  287  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  42.15 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.71 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  37.14 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.41 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.15 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.42 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.43 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15581  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.08 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.55 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.09 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2406  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  40.74 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.385305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.27 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.95 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  28.46 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16181  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.33 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.92 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0666  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  27.43 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.177829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.45 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.63 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.41 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.76 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.6 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18391  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.05 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.9 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.61 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.38 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.19 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1237  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.75 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.6 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0971  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.23 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.16 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  31 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.58 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.03 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  36.47 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.97 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.58 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.67 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.17 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.69 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.89 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.27 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  36.78 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.14 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.89 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.35 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.1 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0337  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.79 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2128  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.61 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000357189  hitchhiker  0.00501726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.46 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.29 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.91 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.53 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  25.83 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.19 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5017  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.91 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.05 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.56 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1563  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.3 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000113638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.33 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.32 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.64 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.19 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  24.65 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.94 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.29 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.06 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0654  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.65 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.70477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  30.23 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.81 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.16 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>