More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4010 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  100 
 
 
94 aa  183  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  88.3 
 
 
94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1837  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  70.11 
 
 
93 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  69.14 
 
 
129 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.02 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29540  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.54 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.497056  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.63 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.44 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1256  ATP synthase F1, epsilon subunit  54.65 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.83 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0381  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.66 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  46.34 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11338  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4327  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  0.0303459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2319  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2337  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  51.22 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000264962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3875  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.78 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3861  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.78 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00697142  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.78 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00323652  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18170  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  58.54 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.316901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1271  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  56.25 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.472876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2128  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.44 
 
 
130 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000357189  hitchhiker  0.00501726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2604  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  51.22 
 
 
94 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000410324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  49.4 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0654  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.66 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.70477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1219  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.94 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10040  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  48.19 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3915  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.66 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  50 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1308  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  45.57 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279861  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.34 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.88 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1922  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.63 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2447  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  44.94 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.121306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.24 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.24 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0337  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.28 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3965  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.71 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000264026  normal  0.273139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.88 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3052  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.24 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.13 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.12 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.15 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2909  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.06 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.15 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.24 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5120  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.35 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08190  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  45.12 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115051  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.21 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.83 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.98 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.51 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.56 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.35 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.56 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.56 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.13 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.53 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5729  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337873  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.91 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5598  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.25 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.68 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2406  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  46.59 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.385305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2164  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.18 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.71 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
86 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.35 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>