More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1219 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1219  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
150 aa  288  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59 
 
 
133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0381  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.41 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2128  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.19 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000357189  hitchhiker  0.00501726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.41 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.9 
 
 
121 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29540  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.83 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.497056  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2406  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  53 
 
 
137 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.385305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  45.05 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1271  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  52.5 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.472876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  42.61 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0654  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.62 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.70477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  52.94 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18170  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  49.38 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.316901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11338  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.32 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  51.76 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0337  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.31 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1837  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  50 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3915  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.15 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2604  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  46.84 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000410324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.42 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08190  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  45.57 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.115051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.15 
 
 
85 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2337  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  45.57 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000264962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10040  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  48.75 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.15 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3861  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00697142  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3875  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00323652  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4327  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.16 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  0.0303459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2447  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  48.78 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.121306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.94 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.29 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.8 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.21 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.3 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.33 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.32 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2319  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.05 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397323  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  33.83 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.53 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.38 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1773  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  49.25 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.03 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1922  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.44 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.03 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.59 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.03 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.08 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.63 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.6 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.62 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.08 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.65 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.76 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  36.63 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.79 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.88 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.84 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.6 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.59 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5017  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  32.33 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.17 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.46 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.16 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.47 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.47 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.77 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.31 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.03 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.3 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.08 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.88 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>