59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5302 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1241  malonate decarboxylase, alpha subunit  59.12 
 
 		 548 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0564492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2895  alpha subunit of malonate decarboxylase  62.34 
 
 		 560 aa  658    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5374  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.34 
 
 		 560 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0394956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5087  malonate decarboxylase, alpha subunit  93.73 
 
 		 558 aa  1074    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10280  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.05 
 
 		 553 aa  1011    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.963977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3779  malonate decarboxylase, alpha subunit  77.16 
 
 		 551 aa  886    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0292  malonate decarboxylase subunit alpha  86.51 
 
 		 554 aa  1004    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1768  malonate decarboxylase, alpha subunit  63.1 
 
 		 560 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2050  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.89 
 
 		 548 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0024  malonate decarboxylase, alpha subunit  59.45 
 
 		 548 aa  685    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2438  malonate decarboxylase, alpha subunit  88.31 
 
 		 553 aa  1017    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2883  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.95 
 
 		 553 aa  1018    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0167  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.22 
 
 		 548 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0794  alpha subunit of malonate decarboxylase  56.2 
 
 		 548 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0723769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6857  malonate decarboxylase, alpha subunit  58.91 
 
 		 548 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0079  malonate decarboxylase, alpha subunit  63.77 
 
 		 566 aa  684    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1159  malonate decarboxylase, alpha subunit  58.94 
 
 		 548 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.20265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5087  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.51 
 
 		 563 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14499  normal  0.0521062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4821  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.51 
 
 		 560 aa  807    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0894844  normal  0.0340709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4939  malonate decarboxylase, alpha subunit  85.92 
 
 		 562 aa  960    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0046  malonate decarboxylase, alpha subunit  61.43 
 
 		 548 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1081  malonate decarboxylase, alpha subunit  59.71 
 
 		 547 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.981649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3151  malonate decarboxylase, alpha subunit  58.91 
 
 		 548 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3192  malonate decarboxylase, alpha subunit  59.2 
 
 		 548 aa  670    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0025  malonate decarboxylase, alpha subunit  58.91 
 
 		 548 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1843  alpha subunit of malonate decarboxylase  59.32 
 
 		 558 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2612  malonate decarboxylase, alpha subunit  77.47 
 
 		 551 aa  875    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2493  hypothetical protein  55.92 
 
 		 548 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0442  malonate decarboxylase, alpha subunit  94.09 
 
 		 558 aa  1079    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1146  malonate decarboxylase, alpha subunit  57.09 
 
 		 551 aa  648    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1247  malonate decarboxylase, alpha subunit  77.88 
 
 		 551 aa  894    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4020  alpha subunit of malonate decarboxylase  58.08 
 
 		 554 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0677734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4925  malonate decarboxylase alpha subunit  76.53 
 
 		 552 aa  894    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5302  malonate decarboxylase, alpha subunit  100 
 
 		 556 aa  1140    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175819  normal  0.165276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4412  hypothetical protein  59.12 
 
 		 548 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1322  alpha subunit of malonate decarboxylase  55.96 
 
 		 557 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2896  alpha subunit of malonate decarboxylase  55.17 
 
 		 554 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.907354  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4593  malonate decarboxylase alpha subunit  61.98 
 
 		 552 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.971648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1844  malonate decarboxylase alpha subunit  69.98 
 
 		 553 aa  806    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0934174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0788  hypothetical protein  59.12 
 
 		 548 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1147  hypothetical protein  58.76 
 
 		 548 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02550  malonate decarboxylase alpha subunit  87.05 
 
 		 554 aa  1006    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000992861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1269  hypothetical protein  59.12 
 
 		 548 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0070497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3659  malonate decarboxylase alpha subunit  68.74 
 
 		 551 aa  811    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0946  malonate decarboxylase alpha subunit  80.59 
 
 		 552 aa  914    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0547141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3863  malonate decarboxylase, alpha subunit  85.92 
 
 		 562 aa  960    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1057  alpha subunit of malonate decarboxylase  54.69 
 
 		 554 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4286  hypothetical protein  57.06 
 
 		 536 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.345597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3298  alpha subunit of malonate decarboxylase  54.94 
 
 		 554 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2803  malonate decarboxylase alpha-subunit  60.42 
 
 		 548 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.656289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1582  malonate decarboxylase alpha-subunit  60.81 
 
 		 548 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1482  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.81 
 
 		 548 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1452  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.62 
 
 		 548 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0539  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  60.62 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0614  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  60.62 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1256  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  60.62 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.604536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3037  malonate decarboxylase alpha-subunit  60.62 
 
 		 546 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0844696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 663 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  28.18 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>