67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0079 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0079  malonate decarboxylase, alpha subunit  100 
 
 		 566 aa  1152    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1452  malonate decarboxylase, alpha subunit  71.16 
 
 		 548 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1482  malonate decarboxylase, alpha subunit  71.35 
 
 		 548 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5087  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.08 
 
 		 558 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3779  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.94 
 
 		 551 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4286  hypothetical protein  69.75 
 
 		 536 aa  768    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.345597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0292  malonate decarboxylase subunit alpha  64.13 
 
 		 554 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1768  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.01 
 
 		 560 aa  931    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2050  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.29 
 
 		 548 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0024  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.64 
 
 		 548 aa  805    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2438  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.5 
 
 		 553 aa  692    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2883  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.5 
 
 		 553 aa  693    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0167  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.4 
 
 		 548 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1241  malonate decarboxylase, alpha subunit  69.57 
 
 		 548 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0564492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6857  malonate decarboxylase, alpha subunit  68.24 
 
 		 548 aa  788    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0539  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  71.16 
 
 		 546 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1159  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.29 
 
 		 548 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.20265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5087  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.32 
 
 		 563 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14499  normal  0.0521062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4821  malonate decarboxylase, alpha subunit  59.75 
 
 		 560 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0894844  normal  0.0340709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4939  malonate decarboxylase, alpha subunit  63.21 
 
 		 562 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0046  malonate decarboxylase, alpha subunit  71.51 
 
 		 548 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1081  malonate decarboxylase, alpha subunit  79.49 
 
 		 547 aa  894    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.981649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3192  malonate decarboxylase, alpha subunit  68.1 
 
 		 548 aa  771    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0025  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.46 
 
 		 548 aa  802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3151  malonate decarboxylase, alpha subunit  69.41 
 
 		 548 aa  791    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10280  malonate decarboxylase, alpha subunit  61.64 
 
 		 553 aa  678    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.963977  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5374  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.69 
 
 		 560 aa  947    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0394956  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3863  malonate decarboxylase, alpha subunit  63.21 
 
 		 562 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1247  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.93 
 
 		 551 aa  705    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2612  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.87 
 
 		 551 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2895  alpha subunit of malonate decarboxylase  85.41 
 
 		 560 aa  939    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3037  malonate decarboxylase alpha-subunit  71.16 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0844696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2493  hypothetical protein  61.93 
 
 		 548 aa  739    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0442  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.08 
 
 		 558 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1146  malonate decarboxylase, alpha subunit  66.55 
 
 		 551 aa  790    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4020  alpha subunit of malonate decarboxylase  75.14 
 
 		 554 aa  833    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0677734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4925  malonate decarboxylase alpha subunit  61.4 
 
 		 552 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1582  malonate decarboxylase alpha-subunit  71.35 
 
 		 548 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5302  malonate decarboxylase, alpha subunit  61.9 
 
 		 556 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175819  normal  0.165276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4412  hypothetical protein  69.87 
 
 		 548 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1322  alpha subunit of malonate decarboxylase  63.08 
 
 		 557 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2803  malonate decarboxylase alpha-subunit  71.1 
 
 		 548 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.656289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3298  alpha subunit of malonate decarboxylase  63.29 
 
 		 554 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1843  alpha subunit of malonate decarboxylase  82.21 
 
 		 558 aa  942    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1057  alpha subunit of malonate decarboxylase  63.29 
 
 		 554 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4593  malonate decarboxylase alpha subunit  57.9 
 
 		 552 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.971648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0614  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  71.16 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0794  alpha subunit of malonate decarboxylase  69.2 
 
 		 548 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0723769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2896  alpha subunit of malonate decarboxylase  68.2 
 
 		 554 aa  798    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.907354  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1256  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  71.16 
 
 		 546 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.604536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0946  malonate decarboxylase alpha subunit  62.7 
 
 		 552 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0547141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3659  malonate decarboxylase alpha subunit  59.21 
 
 		 551 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1269  hypothetical protein  69.38 
 
 		 548 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0070497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02550  malonate decarboxylase alpha subunit  63.77 
 
 		 554 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000992861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1147  hypothetical protein  70.42 
 
 		 548 aa  794    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0788  hypothetical protein  69.38 
 
 		 548 aa  779    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1844  malonate decarboxylase alpha subunit  60.42 
 
 		 553 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0934174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  27.33 
 
 		 660 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  27.33 
 
 		 660 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  27.33 
 
 		 660 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  27.33 
 
 		 660 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  25.67 
 
 		 663 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  25.14 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  25.65 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  25.5 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  26.77 
 
 		 646 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  27.05 
 
 		 523 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>