61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1159  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.58 
 
 		 548 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.20265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5087  malonate decarboxylase, alpha subunit  86.02 
 
 		 558 aa  999    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1482  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.62 
 
 		 548 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3779  malonate decarboxylase, alpha subunit  76.35 
 
 		 551 aa  874    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0363623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4286  hypothetical protein  59.07 
 
 		 536 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.345597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0292  malonate decarboxylase subunit alpha  97.47 
 
 		 554 aa  1100    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1768  malonate decarboxylase, alpha subunit  64.74 
 
 		 560 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2050  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.62 
 
 		 548 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0024  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.77 
 
 		 548 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2438  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.36 
 
 		 553 aa  1000    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2883  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.36 
 
 		 553 aa  1000    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0167  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.04 
 
 		 548 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1241  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.4 
 
 		 548 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0564492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6857  malonate decarboxylase, alpha subunit  61.09 
 
 		 548 aa  697    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0079  malonate decarboxylase, alpha subunit  65.28 
 
 		 566 aa  698    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1452  malonate decarboxylase, alpha subunit  62.43 
 
 		 548 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5087  malonate decarboxylase, alpha subunit  69.54 
 
 		 563 aa  800    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.14499  normal  0.0521062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4821  malonate decarboxylase, alpha subunit  70.09 
 
 		 560 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0894844  normal  0.0340709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4939  malonate decarboxylase, alpha subunit  85.37 
 
 		 562 aa  958    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0046  malonate decarboxylase, alpha subunit  63.18 
 
 		 548 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1081  malonate decarboxylase, alpha subunit  61.57 
 
 		 547 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.981649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3192  malonate decarboxylase, alpha subunit  59.56 
 
 		 548 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0025  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.4 
 
 		 548 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3151  malonate decarboxylase, alpha subunit  60.95 
 
 		 548 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10280  malonate decarboxylase, alpha subunit  88.45 
 
 		 553 aa  1019    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.963977  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5374  malonate decarboxylase, alpha subunit  63.97 
 
 		 560 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0394956  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3863  malonate decarboxylase, alpha subunit  85.37 
 
 		 562 aa  958    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1247  malonate decarboxylase, alpha subunit  76.35 
 
 		 551 aa  876    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2612  malonate decarboxylase, alpha subunit  76.35 
 
 		 551 aa  871    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2895  alpha subunit of malonate decarboxylase  62.52 
 
 		 560 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2493  hypothetical protein  56.65 
 
 		 548 aa  648    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0442  malonate decarboxylase, alpha subunit  86.02 
 
 		 558 aa  999    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1146  malonate decarboxylase, alpha subunit  56.64 
 
 		 551 aa  648    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4020  alpha subunit of malonate decarboxylase  59.93 
 
 		 554 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0677734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4925  malonate decarboxylase alpha subunit  76.81 
 
 		 552 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1582  malonate decarboxylase alpha-subunit  62.62 
 
 		 548 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5302  malonate decarboxylase, alpha subunit  87.05 
 
 		 556 aa  1006    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175819  normal  0.165276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4412  hypothetical protein  60.58 
 
 		 548 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1322  alpha subunit of malonate decarboxylase  57.61 
 
 		 557 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2803  malonate decarboxylase alpha-subunit  62.62 
 
 		 548 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.656289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3298  alpha subunit of malonate decarboxylase  56.16 
 
 		 554 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.217878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1843  alpha subunit of malonate decarboxylase  59.89 
 
 		 558 aa  676    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1057  alpha subunit of malonate decarboxylase  56.16 
 
 		 554 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1844  malonate decarboxylase alpha subunit  70.18 
 
 		 553 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0934174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0788  hypothetical protein  60.58 
 
 		 548 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1147  hypothetical protein  60.4 
 
 		 548 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02550  malonate decarboxylase alpha subunit  100 
 
 		 554 aa  1124    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000992861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1269  hypothetical protein  60.58 
 
 		 548 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0070497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4593  malonate decarboxylase alpha subunit  61.66 
 
 		 552 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.971648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3659  malonate decarboxylase alpha subunit  68.99 
 
 		 551 aa  820    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0794  alpha subunit of malonate decarboxylase  58.03 
 
 		 548 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0723769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0946  malonate decarboxylase alpha subunit  80 
 
 		 552 aa  903    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0547141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2896  alpha subunit of malonate decarboxylase  56.99 
 
 		 554 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.907354  normal  0.0141944 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3037  malonate decarboxylase alpha-subunit  62.43 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0844696  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0614  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  62.43 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0539  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  62.43 
 
 		 546 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1256  putative malonate decarboxylase, alpha subunit  62.43 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.604536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  27.73 
 
 		 663 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  24.93 
 
 		 663 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  28.46 
 
 		 667 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  25.07 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>