More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3869 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 245 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  85.66 
 
 		 246 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  85.25 
 
 		 246 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  81.22 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  81.22 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  76.54 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  75.51 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.75 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  57.56 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  53.53 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  54.81 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.5 
 
 		 246 aa  254  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  54.73 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  54.73 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.7 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  54.32 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  50.21 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  52.54 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.62 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.25 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.04 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.79 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.21 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.06 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  46.91 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.89 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.89 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  38.1 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  44.64 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  42.74 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.16 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  45.54 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.42 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  41.84 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.49 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  42.08 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.59 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  40.17 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.67 
 
 		 286 aa  171  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.15 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  43.15 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.93 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  36.78 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  39 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.17 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.04 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.59 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  38.59 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.5 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.24 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  37.92 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  43.66 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.98 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.98 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.98 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  35.39 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  38.14 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  40.17 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.16 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  35.8 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  37.77 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  37.02 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  33.47 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  44.98 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  35.56 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.84 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  38.8 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.8 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  40.87 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  36.63 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.1 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  39.42 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  36.44 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  35.39 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.35 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.39 
 
 		 291 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  39.13 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.86 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  35.92 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  35.41 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  39.42 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  39.23 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  36.99 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.16 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  38.94 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.71 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  33.74 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  34.41 
 
 		 297 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  38.4 
 
 		 286 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.71 
 
 		 305 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.51 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  36.67 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  36.67 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.8 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  37 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  40.69 
 
 		 290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  33.6 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>