More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0622 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 268 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  74.21 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  65.84 
 
 		 244 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  52.92 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.33 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  48.88 
 
 		 264 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  48.88 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  48.03 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.03 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  50.38 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  50.76 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.39 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  49.21 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  46.15 
 
 		 263 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  50.39 
 
 		 280 aa  244  8e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  49.21 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  47.45 
 
 		 280 aa  239  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  43.87 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  45.35 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.06 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.06 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.06 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.36 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.48 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  47.84 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.67 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  47.67 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  48.4 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  45 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  45.38 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.69 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  45.77 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.8 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  44.62 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  43.58 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  42.21 
 
 		 301 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.14 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  44.58 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  40.78 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  43.25 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.91 
 
 		 263 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 290 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  44 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.97 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  37.91 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.61 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  41.51 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.61 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  42.41 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.4 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  42.25 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  40.94 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  44.18 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.43 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.5 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  42.05 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.6 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.58 
 
 		 295 aa  205  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  40.23 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  40.23 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.48 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  40.94 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.55 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  43.37 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.45 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.55 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  41.57 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  41.6 
 
 		 290 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  40.16 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.55 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  41.18 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.94 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  39.46 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  41.8 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  41.63 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.04 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.1 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.76 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.76 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.48 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  36.96 
 
 		 292 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  40.47 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  41.88 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.65 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  43.8 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  38.65 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  41.45 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  39.53 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.53 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  41.94 
 
 		 286 aa  188  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.23 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.18 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.04 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.65 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  36.76 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.47 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.4 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.43 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  40.96 
 
 		 297 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>