More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2065 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  69.29 
 
 
261 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  65.37 
 
 
292 aa  338  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  62.2 
 
 
268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  59.38 
 
 
263 aa  322  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.91 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.03 
 
 
263 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  54.9 
 
 
265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  53.49 
 
 
258 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  49.22 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  45.95 
 
 
263 aa  250  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  47.51 
 
 
269 aa  238  6.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  44 
 
 
279 aa  237  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  47.86 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  48.25 
 
 
256 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  47.31 
 
 
270 aa  226  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  44.14 
 
 
268 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  45.88 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  45.35 
 
 
254 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  46.98 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  46.98 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  46.98 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  48.34 
 
 
252 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  40.07 
 
 
280 aa  202  5e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.76 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.94 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.95 
 
 
280 aa  199  5e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  41.15 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.31 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  43.19 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  42.02 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  42.75 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  42.02 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  42.92 
 
 
245 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1187  purine phosphorylase family 2  44.83 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.85 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  42.91 
 
 
249 aa  195  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  42.02 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  44.13 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.15 
 
 
297 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  41.63 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.85 
 
 
267 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  40.86 
 
 
269 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  40.7 
 
 
286 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  41.18 
 
 
258 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.31 
 
 
295 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 
292 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2403  methylthioadenosine phosphorylase  41.47 
 
 
276 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  45.29 
 
 
250 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  45.75 
 
 
255 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  40.86 
 
 
287 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  39.75 
 
 
262 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  40.7 
 
 
287 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.14 
 
 
280 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.15 
 
 
248 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  42.26 
 
 
270 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  42.26 
 
 
270 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.15 
 
 
248 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  37.21 
 
 
287 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.15 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.81 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  40.38 
 
 
288 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.26 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  38.95 
 
 
297 aa  182  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  43.21 
 
 
248 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.1 
 
 
289 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.08 
 
 
290 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.25 
 
 
245 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.67 
 
 
246 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.96 
 
 
291 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  39.53 
 
 
284 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  41.41 
 
 
257 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  39.15 
 
 
287 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.91 
 
 
291 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.17 
 
 
248 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  45.02 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  39.53 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43 
 
 
291 aa  178  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  38.76 
 
 
287 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.08 
 
 
267 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  41.25 
 
 
246 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  41.26 
 
 
296 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  39.15 
 
 
287 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  37.26 
 
 
293 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.59 
 
 
245 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.59 
 
 
245 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.08 
 
 
290 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.31 
 
 
273 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.49 
 
 
245 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  41.31 
 
 
286 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.67 
 
 
290 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.6 
 
 
316 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.86 
 
 
258 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.91 
 
 
248 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.08 
 
 
290 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.55 
 
 
289 aa  175  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  39.06 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1225  purine phosphorylase family 2  41.63 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.338671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  38.91 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.95 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>