245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3088 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
301 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  63.16 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.87 
 
 
267 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.32 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  55.89 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  56.37 
 
 
264 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.21 
 
 
273 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.79 
 
 
267 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.27 
 
 
258 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.27 
 
 
258 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  56.2 
 
 
263 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.27 
 
 
258 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.26 
 
 
258 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  55.95 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.06 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  50.38 
 
 
264 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.46 
 
 
262 aa  222  6e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  42.64 
 
 
270 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  42.21 
 
 
268 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  41.57 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  43.02 
 
 
257 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  41.8 
 
 
244 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  38.08 
 
 
263 aa  209  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.16 
 
 
269 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  46.39 
 
 
288 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  46.15 
 
 
280 aa  202  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.69 
 
 
286 aa  202  8e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.63 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  39.62 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  38.16 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  39.02 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  39.02 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.13 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  39.77 
 
 
287 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  42.96 
 
 
296 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  43.77 
 
 
286 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  40.62 
 
 
284 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  47.58 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  41.09 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.38 
 
 
280 aa  188  8e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  40.39 
 
 
286 aa  188  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  42.19 
 
 
287 aa  188  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  42.19 
 
 
287 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  43.85 
 
 
297 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.79 
 
 
305 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.08 
 
 
263 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  44.1 
 
 
286 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  44.68 
 
 
290 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.08 
 
 
290 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  42.31 
 
 
301 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  32.97 
 
 
279 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  47.21 
 
 
298 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.19 
 
 
261 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.37 
 
 
290 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.09 
 
 
248 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  41.41 
 
 
287 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.1 
 
 
297 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  43.18 
 
 
293 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.84 
 
 
245 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  43.18 
 
 
293 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  43.08 
 
 
268 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  41.8 
 
 
265 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  40.39 
 
 
292 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  42.42 
 
 
293 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.72 
 
 
289 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.85 
 
 
295 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  47.69 
 
 
255 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  43.49 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.91 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  39.62 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.4 
 
 
253 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  40.16 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.07 
 
 
310 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  34.9 
 
 
303 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  45.81 
 
 
303 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.07 
 
 
291 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.7 
 
 
316 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.43 
 
 
297 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.43 
 
 
297 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  35.69 
 
 
297 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  44.06 
 
 
290 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  40.55 
 
 
302 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.24 
 
 
289 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.67 
 
 
248 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.89 
 
 
304 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.14 
 
 
290 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.58 
 
 
290 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36 
 
 
299 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.68 
 
 
245 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  45.02 
 
 
270 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  45.02 
 
 
270 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.83 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.66 
 
 
246 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.75 
 
 
245 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  40.17 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  40.25 
 
 
246 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.93 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.91 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.86 
 
 
256 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>