More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0435 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  87.14 
 
 
280 aa  527  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  87.86 
 
 
280 aa  527  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  86.07 
 
 
280 aa  519  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  75.48 
 
 
286 aa  436  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  59.92 
 
 
270 aa  315  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  60.16 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  56.92 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  55.02 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  47.66 
 
 
263 aa  248  8e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  47.84 
 
 
268 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  47.77 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  46.24 
 
 
288 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  45.04 
 
 
287 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.37 
 
 
260 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  49.03 
 
 
264 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  48.21 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  44.09 
 
 
297 aa  219  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.63 
 
 
290 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  48.74 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  45.34 
 
 
244 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  42.37 
 
 
286 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 
284 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  42.86 
 
 
287 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  44.13 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  44.14 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  41.79 
 
 
279 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.53 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.35 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  43.65 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.97 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  48.57 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  47.56 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.53 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  43.31 
 
 
297 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.31 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  42.57 
 
 
294 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  42.29 
 
 
294 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.31 
 
 
297 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  46.37 
 
 
263 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  44.75 
 
 
292 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.18 
 
 
267 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  41.73 
 
 
287 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.13 
 
 
290 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.13 
 
 
290 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.26 
 
 
290 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.13 
 
 
289 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.09 
 
 
261 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.75 
 
 
263 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  40.84 
 
 
294 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.2 
 
 
290 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 
289 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  43.14 
 
 
286 aa  205  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.61 
 
 
290 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  41.29 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  45.93 
 
 
298 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  41.5 
 
 
293 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.08 
 
 
297 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  43.78 
 
 
268 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  41.2 
 
 
290 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  41.2 
 
 
290 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  41.41 
 
 
303 aa  201  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  45.38 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.14 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  43.15 
 
 
265 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.35 
 
 
316 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.63 
 
 
273 aa  198  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.55 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  44.09 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  44.09 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  41.46 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  42.74 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.46 
 
 
310 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  43.31 
 
 
293 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.06 
 
 
295 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.52 
 
 
294 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  41.31 
 
 
296 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.83 
 
 
304 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  43.53 
 
 
292 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.57 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.29 
 
 
291 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  37.9 
 
 
249 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  37.94 
 
 
302 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.9 
 
 
291 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  44.88 
 
 
292 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.31 
 
 
258 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.31 
 
 
258 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.31 
 
 
258 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.94 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.04 
 
 
291 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  47.83 
 
 
257 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  39.3 
 
 
287 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  45.42 
 
 
264 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.65 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.91 
 
 
264 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  42.8 
 
 
297 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.39 
 
 
295 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.85 
 
 
291 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>