297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2068 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  81.6 
 
 		 290 aa  490  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  78.2 
 
 		 290 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  77.51 
 
 		 290 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  77.85 
 
 		 290 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  71.63 
 
 		 289 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  63.32 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  63.51 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  62.8 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  64.56 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.15 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.07 
 
 		 291 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.11 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.72 
 
 		 291 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.05 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.35 
 
 		 291 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.38 
 
 		 301 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.95 
 
 		 291 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.95 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.38 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.23 
 
 		 295 aa  330  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.65 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.68 
 
 		 291 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.1 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  55.24 
 
 		 290 aa  311  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  52.6 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  52.26 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  52.25 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  51.56 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  50.36 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  50 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  50.56 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.65 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  51.05 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.44 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  50.52 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  48.79 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  50.9 
 
 		 293 aa  270  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  50.35 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  49.3 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  47.75 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  51.08 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  48.7 
 
 		 275 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  46.74 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  46.74 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  50.96 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.11 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  49.11 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  48.69 
 
 		 290 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  49.3 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.42 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  50 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  49.65 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  49.3 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  48.78 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  48.12 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.25 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.11 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.64 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  45.32 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.32 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  45.06 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  45.59 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  47.1 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  46.97 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  46.42 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  46.42 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  42.69 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  47.37 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  45.83 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  44.19 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.83 
 
 		 269 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  47.28 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.08 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.31 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  43.44 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  45 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.78 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.25 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  45.17 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  40.96 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.23 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  44.53 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  43.92 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.13 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  41.41 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  43.55 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.13 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  42.86 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  41.7 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  38.95 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.1 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.04 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  44.88 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  41.72 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  43.27 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  41.41 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  47.17 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.7 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>