More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2021 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  71.58 
 
 		 286 aa  434  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  70.03 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  67.94 
 
 		 287 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  68.29 
 
 		 287 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  66.55 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  67.6 
 
 		 287 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  65.72 
 
 		 284 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  57.54 
 
 		 292 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  56.38 
 
 		 294 aa  351  7e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.62 
 
 		 291 aa  350  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  55.32 
 
 		 294 aa  350  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  56.03 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  56.31 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  54.64 
 
 		 290 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  53.61 
 
 		 290 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.31 
 
 		 290 aa  331  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  55.47 
 
 		 275 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  57.41 
 
 		 286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  53.85 
 
 		 290 aa  324  8.000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  52.92 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  52.92 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  55.24 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  54.96 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.9 
 
 		 295 aa  311  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  54.17 
 
 		 290 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.29 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  54.2 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  53.19 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.43 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  53.45 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.47 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  51.23 
 
 		 303 aa  298  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.47 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.78 
 
 		 290 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.6 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.92 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.88 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.48 
 
 		 310 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  49.48 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  49.65 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.03 
 
 		 291 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  47.2 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.07 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.55 
 
 		 297 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.55 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.48 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.62 
 
 		 291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  50.17 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.72 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  48.8 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.52 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.97 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.28 
 
 		 291 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.28 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  46.51 
 
 		 263 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  47.17 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.59 
 
 		 291 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  48.64 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  48.98 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  48.64 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  44.75 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  45.96 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.28 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.31 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.61 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  46.67 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.66 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  46.02 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.83 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  40.68 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  45.08 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  44.19 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  41.24 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.42 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.63 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.27 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  40.78 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.66 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  40.77 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  41.87 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  37.79 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  43.92 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.04 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  44.31 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  45.49 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.49 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  43.09 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.7 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  38.37 
 
 		 263 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.35 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.8 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.8 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.8 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.32 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.35 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  41.54 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  43.08 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>