295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6795 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
291 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  92.73 
 
 
291 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  82.7 
 
 
291 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  79.24 
 
 
291 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  78.89 
 
 
291 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  73.7 
 
 
291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  79.58 
 
 
291 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  75.09 
 
 
291 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  73.01 
 
 
301 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  72.32 
 
 
291 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  74.65 
 
 
291 aa  427  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  73.96 
 
 
295 aa  427  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  71.97 
 
 
291 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.98 
 
 
290 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.98 
 
 
290 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  61.69 
 
 
297 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.23 
 
 
290 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.93 
 
 
297 aa  345  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.38 
 
 
289 aa  342  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.54 
 
 
295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.79 
 
 
305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.64 
 
 
294 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.86 
 
 
290 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.44 
 
 
289 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  54.45 
 
 
290 aa  298  7e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  55.8 
 
 
293 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  48.81 
 
 
287 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  46.88 
 
 
292 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  48.07 
 
 
286 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.82 
 
 
291 aa  265  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  46.94 
 
 
290 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  48.28 
 
 
287 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  46.21 
 
 
287 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  48.77 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.62 
 
 
290 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  48.47 
 
 
287 aa  258  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  45.45 
 
 
284 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  46.58 
 
 
290 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  46.58 
 
 
290 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.23 
 
 
290 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  49.09 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  49.31 
 
 
288 aa  251  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  48.07 
 
 
287 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  47.76 
 
 
294 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  47.76 
 
 
294 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.06 
 
 
304 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  46.64 
 
 
294 aa  245  6e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  47.76 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  48.97 
 
 
287 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  47.22 
 
 
298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  46.13 
 
 
290 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  48.97 
 
 
287 aa  241  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  46.84 
 
 
297 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.1 
 
 
316 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  46.94 
 
 
298 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.46 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.27 
 
 
310 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  43.27 
 
 
303 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  46.54 
 
 
286 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.64 
 
 
299 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 
297 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.11 
 
 
297 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  44.49 
 
 
301 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.4 
 
 
262 aa  223  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  45.55 
 
 
296 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  44.36 
 
 
270 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  41.38 
 
 
286 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  42.63 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  44.18 
 
 
269 aa  208  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  39.75 
 
 
249 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  43.3 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  42.8 
 
 
292 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  44.7 
 
 
264 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  42.7 
 
 
293 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  42.7 
 
 
293 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  39.84 
 
 
257 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  41.86 
 
 
355 aa  192  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  42.32 
 
 
293 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  40.39 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  41.57 
 
 
269 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  40.16 
 
 
303 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  38.04 
 
 
268 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  40.65 
 
 
244 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  47.14 
 
 
268 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  38.49 
 
 
257 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.88 
 
 
263 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.84 
 
 
280 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.47 
 
 
286 aa  175  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.13 
 
 
267 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.44 
 
 
280 aa  171  9e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  39.68 
 
 
263 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.44 
 
 
280 aa  170  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  39.3 
 
 
263 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 
255 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  43.28 
 
 
292 aa  168  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  40.16 
 
 
265 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.21 
 
 
263 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.4 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  40.23 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.31 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>