274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3476 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.85 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  45.61 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  48.42 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  44.6 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.8 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.79 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.75 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.51 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.29 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  44.59 
 
 		 293 aa  236  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.81 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  44.21 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  42.81 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  45.55 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.57 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  42.61 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  42.81 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  44.21 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.01 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.46 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.46 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.19 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  44.06 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  45.26 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  43.21 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.46 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  41.32 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  41.32 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  46.07 
 
 		 292 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  45.58 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  46.59 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  46.59 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.11 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  46.59 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  42.76 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.11 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  45.25 
 
 		 262 aa  222  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.11 
 
 		 291 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.49 
 
 		 291 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.11 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  44.98 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  45.35 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.83 
 
 		 289 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  41.89 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  41.03 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  51.8 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  40.77 
 
 		 287 aa  215  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.83 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  42.71 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  45.78 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.75 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.56 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.81 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.21 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.56 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.33 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.49 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.35 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  40.99 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  39.51 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.8 
 
 		 269 aa  202  8e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  43.73 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  43.92 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.58 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  42.37 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.92 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  40.62 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.32 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  40.32 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  41.57 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.39 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  37.93 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  42.31 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  39.68 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  41.15 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.77 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.85 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  40.54 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.79 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  38.05 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  42.47 
 
 		 264 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  40.98 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  42.86 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.46 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.24 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  39.52 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  39.59 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.61 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  36.47 
 
 		 263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.8 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.22 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  38.4 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  35.32 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  37.96 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.55 
 
 		 263 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>