269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1392 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1392  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  76.51 
 
 
303 aa  484  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25331  5'-methylthioadenosine phosphorylase  67.24 
 
 
304 aa  417  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  63.82 
 
 
316 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  60.14 
 
 
303 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.14 
 
 
310 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03341  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.62 
 
 
299 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  60.34 
 
 
290 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  56.75 
 
 
297 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.09 
 
 
297 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.09 
 
 
297 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.79 
 
 
291 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.28 
 
 
290 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  57.09 
 
 
290 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  57.09 
 
 
290 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  55.71 
 
 
290 aa  354  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  56.12 
 
 
290 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2582  methylthioadenosine phosphorylase  59.56 
 
 
275 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  53.33 
 
 
286 aa  315  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  52.07 
 
 
287 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  50.18 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  53.45 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2626  methylthioadenosine phosphorylase  51.21 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  50.34 
 
 
293 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  52.63 
 
 
287 aa  295  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  48.97 
 
 
287 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  51.57 
 
 
284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  49.66 
 
 
287 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.62 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  51.46 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  46.85 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  48.97 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  47.2 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  46.37 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0626  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.3 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  50.17 
 
 
288 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0486  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.59 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1474  methylthioadenosine phosphorylase  51.04 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244682  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.45 
 
 
295 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.84 
 
 
294 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1837  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.88 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  54.31 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  49.83 
 
 
298 aa  268  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.66 
 
 
291 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2324  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.31 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.36 
 
 
289 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.77 
 
 
291 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2068  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.08 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250536  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.42 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4408  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.82 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.18 
 
 
291 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10230  5'-methylthioadenosine phosphorylase (Meu1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08720)  49.8 
 
 
355 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0600587  normal  0.0456068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.47 
 
 
301 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  49.31 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.77 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.77 
 
 
291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.07 
 
 
291 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7534  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.53 
 
 
291 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.02 
 
 
295 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  49.64 
 
 
290 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  54.94 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  43.66 
 
 
286 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.45 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65182  predicted protein  49.21 
 
 
332 aa  241  7.999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.306629 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  41.16 
 
 
296 aa  229  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  44.81 
 
 
270 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  44.15 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  45.74 
 
 
287 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  45.14 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  41.83 
 
 
263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  42.16 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01530  glutamate biosynthesis-related protein, putative  40.4 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  44.44 
 
 
293 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  44.44 
 
 
293 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  43.02 
 
 
269 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3476  methylthioadenosine phosphorylase  45.78 
 
 
301 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  40.15 
 
 
257 aa  208  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  42.86 
 
 
279 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  46.58 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  45.12 
 
 
264 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  46.78 
 
 
257 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  39.04 
 
 
249 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  41.91 
 
 
269 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.22 
 
 
267 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.37 
 
 
280 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  38.65 
 
 
268 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  38.98 
 
 
257 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.91 
 
 
280 aa  189  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.52 
 
 
280 aa  189  5e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  38.71 
 
 
244 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.26 
 
 
258 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.26 
 
 
258 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.26 
 
 
258 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.63 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.4 
 
 
264 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.04 
 
 
258 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  44.55 
 
 
263 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.3 
 
 
267 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  41.57 
 
 
263 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>