More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1986 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  63.9 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  61.16 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.75 
 
 
245 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  63.49 
 
 
248 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  59.76 
 
 
246 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.76 
 
 
246 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.66 
 
 
245 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  62.24 
 
 
245 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  61.92 
 
 
245 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  60.96 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  58.9 
 
 
262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  59.49 
 
 
245 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  60.74 
 
 
246 aa  274  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.28 
 
 
253 aa  261  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  52.07 
 
 
255 aa  260  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  58.22 
 
 
248 aa  258  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.55 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  55.19 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.48 
 
 
256 aa  251  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.53 
 
 
243 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  54.39 
 
 
270 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  54.39 
 
 
270 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.85 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.44 
 
 
248 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  49.57 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  47.93 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  46.43 
 
 
268 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.83 
 
 
263 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  36.78 
 
 
279 aa  192  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.82 
 
 
260 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  45.91 
 
 
263 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  42.56 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.83 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  46.36 
 
 
292 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.88 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  41.35 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  42.67 
 
 
258 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.32 
 
 
262 aa  175  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.95 
 
 
267 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2590  methylthioadenosine phosphorylase  39.66 
 
 
286 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  35 
 
 
263 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  41.7 
 
 
263 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  41.25 
 
 
269 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.79 
 
 
305 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.42 
 
 
297 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  40.08 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  43.57 
 
 
301 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  42.73 
 
 
264 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  39.5 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.11 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.95 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.6 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.93 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.85 
 
 
258 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.24 
 
 
258 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.24 
 
 
258 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  36.73 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.56 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0739  methylthioadenosine phosphorylase  44.6 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.104422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  38.14 
 
 
270 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.73 
 
 
291 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.8 
 
 
267 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  38.66 
 
 
294 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  38.66 
 
 
294 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.15 
 
 
291 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  40.95 
 
 
286 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.98 
 
 
295 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  38.94 
 
 
257 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2145  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.76 
 
 
295 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.82 
 
 
286 aa  158  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.67 
 
 
291 aa  158  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  41.5 
 
 
253 aa  158  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  40.19 
 
 
284 aa  158  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.19 
 
 
291 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.86 
 
 
264 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.56 
 
 
280 aa  156  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.29 
 
 
280 aa  155  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.95 
 
 
258 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  38.2 
 
 
287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  41 
 
 
253 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  41 
 
 
253 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0365  methylthioadenosine phosphorylase  39.01 
 
 
288 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.23 
 
 
291 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1666  methylthioadenosine phosphorylase  36.6 
 
 
303 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.307895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.38 
 
 
290 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.54 
 
 
267 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  39.71 
 
 
287 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03801  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.6 
 
 
310 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.155061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  41.67 
 
 
264 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  42.92 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  37.93 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  39.55 
 
 
258 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.24 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  38.79 
 
 
297 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  34.82 
 
 
290 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4698  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.73 
 
 
301 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3207  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.83 
 
 
289 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0647  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.86 
 
 
291 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>