More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1793 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  47.15 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  48.37 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.37 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.33 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  47.33 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.5 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.54 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.91 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.9 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.45 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.12 
 
 		 243 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  45.15 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  48.42 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  43.43 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.67 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.57 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  43.89 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  45.6 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.44 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.86 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  42.23 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  44.35 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.95 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.27 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  45.49 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  45.49 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  43.48 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  40.89 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  45.34 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  41.37 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.29 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  44.39 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  41.56 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  39.73 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.85 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  39.73 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  37.82 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  39.73 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2786  methylthioadenosine phosphorylase  42.72 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2691  methylthioadenosine phosphorylase  42.72 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  40.35 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1180  methylthioadenosine phosphorylase  42.72 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  38.96 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.92 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3381  methylthioadenosine phosphorylase  41.59 
 
 		 292 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.92 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.92 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.72 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  38.68 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  36.51 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.87 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.36 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  39.92 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  41.28 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  36.95 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  39.72 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.35 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  39.17 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  39.52 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  38.98 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  36.95 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  39.25 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1653  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.19 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.389346 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  40.98 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  38.68 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1187  purine phosphorylase family 2  37.95 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4047  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4009  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  37.55 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0923  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0276  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.85 
 
 		 305 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2557  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01985e-31 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.09 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  36.14 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.82 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  38.31 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  39.45 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  39.29 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  40.65 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10546  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.45 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.0803e-16  normal  0.800963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  38.65 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  39.01 
 
 		 301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3686  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.1 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2947  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.96 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03241  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.81 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  36.05 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1576  methylthioadenosine phosphorylase  35.86 
 
 		 290 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03251  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.81 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0303  methylthioadenosine phosphorylase  39.81 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2618  methylthioadenosine phosphorylase  38.25 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  39.13 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  38.74 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6331  methylthioadenosine phosphorylase  39.53 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.66 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03271  5'-methylthioadenosine phosphorylase  38.14 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1656  methylthioadenosine phosphorylase  39.61 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.339163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>