More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3280 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3280  5'-methylthioadenosine phosphorylase  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3506  phosphorylase, family 2  97.97 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3869  5'-methylthioadenosine phosphorylase  85.66 
 
 		 245 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25210  5'-methylthioadenosine phosphorylase  79.51 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2155  5'-methylthioadenosine phosphorylase  79.1 
 
 		 245 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14550  5'-methylthioadenosine phosphorylase  78.37 
 
 		 245 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1591  5'-methylthioadenosine phosphorylase  76.23 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.737464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1935  purine phosphorylase family 2  57.08 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  59.76 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.379247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1246  methylthioadenosine phosphorylase  55.6 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1329  methylthioadenosine phosphorylase  56.49 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2182  5'-methylthioadenosine phosphorylase  57.38 
 
 		 245 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1751  methylthioadenosine phosphorylase  58.4 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.799483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0457  5'-methylthioadenosine phosphorylase  52.67 
 
 		 246 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0535  methylthioadenosine phosphorylase  55.14 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.145655  unclonable  0.0000000000337191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0365  methylthioadenosine phosphorylase  55.14 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1396  methylthioadenosine phosphorylase  51.04 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1259  purine phosphorylase family 2  52.54 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  51.45 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1467  5'-methylthioadenosine phosphorylase  50.21 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01730  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.11 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2966  5'-methylthioadenosine phosphorylase  49.79 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329142  hitchhiker  0.0000516298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0650  5'-methylthioadenosine phosphorylase  48.76 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.464101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1523  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.39 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  53.39 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1793  methylthioadenosine phosphorylase  48.37 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1738  5'-methylthioadenosine phosphorylase  46.47 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1135  methylthioadenosine phosphorylase  39.29 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1647  methylthioadenosine phosphorylase  45.49 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0928  methylthioadenosine phosphorylase  42.74 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.563621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0963  methylthioadenosine phosphorylase  41.22 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2065  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.67 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0705  5'-methylthioadenosine phosphorylase  43.48 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0778  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.06 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1185  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.98 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000207741  normal  0.0524668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0647  methylthioadenosine phosphorylase  43.98 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.161691  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1577  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  40.5 
 
 		 286 aa  168  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00552276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0704  methylthioadenosine phosphorylase  37.76 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.226582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3088  methylthioadenosine phosphorylase  40.66 
 
 		 301 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3594  methylthioadenosine phosphorylase  38.43 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1878  purine phosphorylase family 2  41.84 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0689  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  35.54 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000166903  unclonable  0.000000263743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0618  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.5 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1393  methylthioadenosine phosphorylase  44.6 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2924  methylthioadenosine phosphorylase  40.08 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8654  methylthioadenosine phosphorylase  38.17 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1572  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.59 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0922  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.25 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.824829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1361  methylthioadenosine phosphorylase  36.07 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000221812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0986  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.68 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1752  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.76 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000364775  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  40.59 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00299011  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0155  methylthioadenosine phosphorylase  37.29 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0926  purine phosphorylase family 2  40.38 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0517  methylthioadenosine phosphorylase  39.42 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0493  methylthioadenosine phosphorylase  38.27 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_458  methylthioadenosine phosphorylase  38.36 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.137534  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3192  methylthioadenosine phosphorylase  38.59 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0582  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  38.24 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000568497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1401  methylthioadenosine phosphorylase  34.03 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0703  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.54 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0697  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.54 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0717  5'-methylthioadenosine phosphorylase  42.54 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100018  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1112  methylthioadenosine phosphorylase  40.87 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0767  purine phosphorylase family 2  38.99 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3766  purine or other phosphorylase family 1  38.39 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0466  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.03 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1184  purine phosphorylase family 2  38.99 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0904  methylthioadenosine phosphorylase  37.34 
 
 		 279 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2684  methylthioadenosine phosphorylase  40 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000567778  normal  0.547568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6795  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.13 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3520  methylthioadenosine phosphorylase  36.73 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1491  methylthioadenosine phosphorylase  38.53 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0422  methylthioadenosine phosphorylase  36.33 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.200646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3607  methylthioadenosine phosphorylase  40.59 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1782  methylthioadenosine phosphorylase  34.57 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154698  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0134  purine phosphorylase family 2  34.39 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3751  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.71 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1155  methylthioadenosine phosphorylase  40.48 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3664  methylthioadenosine phosphorylase  41.46 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5308  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.27 
 
 		 291 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1035  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.91 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2768  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.8 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1582  methylthioadenosine phosphorylase  39.9 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2545  5'-methylthioadenosine phosphorylase  35.8 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0622  methylthioadenosine phosphorylase  34.98 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2475  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.13 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499312  normal  0.0205304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2021  methylthioadenosine phosphorylase  38.94 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0435  5'-methylthioadenosine phosphorylase II  37.76 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0881  5'-methylthioadenosine phosphorylase  41.23 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2245  methylthioadenosine phosphorylase  33.6 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0274311  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0450  methylthioadenosine phosphorylase  43.54 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0182  methylthioadenosine phosphorylase  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00638501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2340  methylthioadenosine phosphorylase  38.4 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1096  methylthioadenosine phosphorylase  37.5 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4909  methylthioadenosine phosphorylase  42 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0361  5'-methylthioadenosine phosphorylase  39.13 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4937  5'-methylthioadenosine phosphorylase  36.1 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0431  methylthioadenosine phosphorylase  35.77 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0158  5'-methylthioadenosine phosphorylase  37.68 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.334691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>